南瓜籽不能和硬殼瓜果一起吃，例如西瓜、哈密瓜等。因為這些瓜果的硬殼很難消化，容易引起消化不良或腸道阻塞。南瓜籽也不宜與堅果類一起食用，如花生、杏仁等，因為兩者同時攝入易導致消化不良。此外，南瓜籽也不宜與藥物一起食用，因為藥物可能與南瓜籽發生相互作用，影響藥效或產生不良反應。最好在食用南瓜籽之前咨詢醫生或專業人士的建議。