1、來源不同：商品房由開發商籌建；保障性住房由政府組織建設。2、購買條件不同：商品房只要有足夠的資金就可以買；但保障性住房必須達到一定條件、要當地政府部門審核批準才能購買或租用。3、產權性質不同：商品房的購買人有完全產權，可以自由處分；但保障性住房中的廉租房只能居住只有使用權，沒有處理房屋的權利；經適房是不完全產權，5年內不得買賣。5年內確需出賣的，由政府回購。5年后可以出賣，但需要上交一定比例的收益金給政府。一、申請保障房需要的材料有哪些。材料。1、家庭成員身份證及戶口簿原件、復印件。2、低保、特困家庭出具《本市城市居民最低生活保障金領取證》原件、復印件或《本市市區特困居民證》原件、復印件。