高速應急車道停車三分鐘內可能會被處罰，根據規定，機動車駕駛人駕駛機動車在高速公路或者城市快速路上違法占用應急車道行駛的，一次扣6分，還會被處罰款。一、機動車不按導向車道行駛怎么處罰。駕駛機動車不按規定車道行駛，通常指不按車道行駛，壓線、騎線行駛。違法行為有以下三種：1.駕駛機動車在高速公路上不按規定車道行駛的，違法代碼：43120，處罰標準：扣3分，罰款50元。2.駕駛機動車在城市快速路上不按規定車道行駛的，違法代碼：13550，處罰標準：扣3分，罰款50元。3.駕駛機動車在高速公路、城市快速路以外的道路上不按規定車道行駛的，違法代碼：60230，處罰標準：不扣分，罰款50元。二、未按導向車道行駛怎么處罰。