1、主觀方面不同；雖然玩忽職守罪與瀆職罪的主觀罪過，都是既可以由故意構成，也可以由過失構成，但是有所不同。瀆職罪主要是由故意構成，個別情況下也可以由過失構成。其中，表現為故意的濫用職權，既可以是直接故意，也可以是間接故意；表現為過失的濫用職權，既可以是過于自信的過失，也可以是疏忽大意的過失。玩忽職守罪主要由過失構成，少數情況下也可以由故意構成。其中，表現為過失的玩忽職守包括疏忽大意的過失和過于自信的過失，表現為故意的玩忽職守可以是間接故意，也可以是直接故意。2、侵犯的直接客體不完全相同。